短发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)是一种经由载体递送并稳定表达的RNA分子,其可在细胞内被加工成小干扰 RNA(siRNA),进而引导RNA诱导沉默复合物(RISC)降解靶信使RNA(mRNA),从而实现特异性基因敲低。单个 shRNA 实验只能研究一个特定基因的功能。然而,生物学中的绝大多数现象(如细胞增殖、死亡、分化、癌症发生、药物反应等)都不是由单个基因决定的,而是由复杂的基因网络共同调控的。因此,要全面理解这些过程,就需要一种能够同时、系统地干扰大量基因并进行筛选的方法。
建立 shRNA 文库的根本原因是生物学问题的复杂性,其核心作用是将 RNAi 技术转化为一种强大的大规模发现工具。泓迅生物利用专利的Syno®合成技术平台,可以快速高效地实现高质量 shRNA 文库构建,满足不同客户对文库的定制化需求,为大规模功能缺失筛选提供高效且经济的解决方案。
服务项目 | 服务详情 | 周期 |
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shRNA 设计 | 针对目标基因进行 shRNA 序列设计 每个基因设计3-6条 shRNA(无物种限制) | 2-3天 |
芯片合成 | 将所设计的所有 shRNA 及阴性对照合成在一张芯片上 | 3-4周 |
shRNA 文库构建 | 将 shRNA 构建到客户的目标载体上 | 4周 |
文库质粒大抽 | 根据发货量进行转染级质粒抽提 | 1周 |
文库质检及 NGS 验证 | 库容量大于100x、覆盖率>90%文库正确率>80%、文库的均一性<5-10 | 2-3周 |
病毒包装 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |