1、利用RNP下的双sgRNA编辑法,实现基因DNA水平片段敲除
案例:对X细胞的A基因进行Exon1-13的片段敲除(KO)
(1)在需求敲除片段两端分别设计1条高靶向的sgRNA序列,如下图:
(2)将gRNA-A1、gRNA-A2进行化学修饰合成后分别与Cas9蛋白组装成RNP,转染至X细胞进行A基因片段序列敲除;
(3)敲除结果检测如下:
DNA水平-Sanger测序显示,A基因序列已被敲除,结果如下:
细胞表型检测如下图:A为正常细胞,B为A基因敲除后的突变细胞形态,表明A基因被敲除。
2、RNP敲除效率远超传统质粒法
案例:以AAVS1位点敲除为例,比较质粒(DNA)与RNP的敲除效率
(1)将AAVS1-sgRNA1序列构建带有Cas9的载体中,转染细胞后提取基因组DNA,以基因组DNA为样本进行Sanger测序并结合Synthego ICE分析软件检测,结果显示敲除率为14%;
(2)将AAVS1-sgRNA1 RNP复合物转染细胞后进行如(1)所述检测,结果显示敲除效率为69%;
(3)敲除效率比较(如下图),结果显示RNP敲除效率是质粒法的4-5倍,显著高于质粒法。