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泓迅生物利用CRISPR-Cas9技术编辑酵母菌中的一个920bp的ADE1基因。ADE1是腺嘌呤合成相关基因,如果ADE1失活,则细胞将会积累红色色素,呈现红色菌落。
阳性克隆菌落
测序结果显示,转化子的ADE1基因缺失了18个碱基,被成功编辑。
图1 mScarlet基因敲入后克隆子的PCR鉴定电泳图
图2 mScarlet基因敲入后大肠杆菌基因组序列。(a)敲入位点上下游基因图谱及测序组装示意图,(b)敲入位点上下游测序序列峰形图。
图3 荧光显微镜下大肠杆菌NC101突变株细胞图像。(a)白光下细胞图片,(b)594 nm光源激发后细胞图片。
培养条件与转化方法的多样性:不同微生物对生长环境的需求各异,这导致在实验室条件下培养它们时需要采用特定的条件。同样,将外源DNA导入这些微生物的转化方法也各不相同,增加了操作的复杂性。
质粒与元件在不同物种间的表达差异:质粒和其他基因编辑元件在不同微生物中的表达效率可能大相径庭。这要求研究人员必须针对目标微生物进行质粒的个性化设计和优化,以确保基因编辑的成功进行。
Cas蛋白敏感性与编辑效果的差异:不同微生物对Cas蛋白的敏感性不同,这直接影响到基因编辑的效率和准确性。因此,针对不同微生物,可能需要筛选和优化特定的Cas蛋白变体,以获得最佳的编辑效果。
微生物自身DNA修复机制的多样性:微生物具有不同的DNA修复机制,这些机制在基因编辑过程中可能起到干扰作用。了解并应对这些修复机制,对于提高基因编辑的成功率和减少脱靶效应至关重要。
针对不同物种的微生物进行基因编辑时,通常需要个性化改造系统质粒、优化转化工艺,并深入了解目标微生物的生物学特性,以确保基因编辑的有效性和精确性。