研究基因在代谢通路或某些特定疾病发生过程中的功能,对于疾病机理研究及药物研发具有非常重要的意义。新一代基因编辑技术CRISPR以其操作简单和通用的独特优势,成为开展正向遗传学筛选实验强有力的工具。利用CRISPR技术建立可能与某类功能相关的突变体库,通过功能性筛选和富集、PCR扩增及深度测序分析,确认与这类功能相关的基因。
泓迅生物利用独创的“GPS”(Genotype,Phenotype,Synotype)平台,提供基于CRISPR sgRNA文库的一站式基因功能筛选服务。我们专利的Syno®合成技术平台,可以快速高效地实现sgRNA文库构建,并包装成慢病毒混合文库后转染细胞。结合高通量/高内涵筛选平台,利用控制细胞存活、结合免疫染色、流式细胞术等手段筛选得到所需细胞,最终通过测序等方法推断出发挥作用的靶基因。
服务项目 | 服务详情 | 周期 |
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sgRNA设计 | 针对目标基因群进行sgRNA序列设计 每个基因设计3-6条sgRNA(无物种限制) | 1-2周 |
芯片合成 | 将所设计的所有sgRNA及阴性对照合成在一张芯片上 | 3-4周 |
sgRNA文库构建 | 将sgRNA构建到客户的目标载体上 | 2-3周 |
文库质粒大抽 | 根据发货量进行转染级质粒抽提 | 1周 |
文库质检及NGS验证 | 库容量大于100x、覆盖率>99% 文库正确率>80%、文库的均一性<5-10 | 2-3周 |
病毒包装 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |
文库细胞pool构建 | 覆盖度高达99%、支持任何癌细胞系为目的细胞的构建 | 6-9周 |
高通量筛选 | 正向筛选实验、反向筛选实验、 药物抗性实验、报告基因检测 | 2-3周 |
基因功能分析与验证 | 文库QC、样本相关性、目标基因分析等 | 1-2工作日 |