文献速递 | 泓迅生物Oligo Pools 再助力!
2022年全球寡核苷酸库(含Oligo Pools)市场规模达28.34亿元,贝哲斯咨询预测到2028年,全球寡核苷酸库市场规模预计将达40.94亿元。
为什么Oligo Pools发展如此迅速?
主要的驱动力来自基因治疗、癌症早筛、农业育种及合成生物学等应用的商业化落地,而Oligo Pools(寡核苷酸池)因其高通量、低成本、高度可定制化的特性,成为上述应用在研究的核心工具之一。比如CRISPR文库筛选在药物靶点发现中的普及,显著拉动了Oligo Pools的需求。此外,在突变体库构建、NGS杂交捕获探针文库、合成生物学和DNA储存等方向Oligo Pools也应用广泛。
Oligo Pools应用解析
01. CRISPR基因编辑
CRISPR/Cas9是一种革命性的基因编辑工具,而Oligo Pools在其应用中扮演着重要角色。通过Oligo Pools建立sgRNA文库,可以筛选出对目标基因编辑效果最佳的sgRNA序列。
02. 突变体库构建
通过Oligo Pools,研究人员能够合成大量含有不同突变的DNA片段,从而创建突变体库,用于筛选出具备优异功能的蛋白质或基因调控序列。
03. NGS杂交捕获探针文库
NGS建库时,通过Oligo Pools合成构建杂交捕获探针文库,既可以用于目的基因的捕获与检测,也可以用于筛选靶序列的特异性探针序列。
04. 荧光原位杂交(FISH)
Oligo Pools通过高通量合成,在短时间内生成大量的具有不同序列的探针,可以覆盖目标区域的多个位点,提高FISH检测的灵敏度和准确性。
05. 合成生物学和DNA数据储存
在合成生物学中,研究人员可以通过Oligo Pools合成DNA片段,并利用DNA拼接技术将其组装成更大的DNA结构,快速实现多基因合成或途径优化。此外,随着DNA储存技术的发展,Oligo Pools的高通量合成能力使其成为DNA数据存储的理想解决方案。
泓迅Oligo Pools助力PNAS文章
泓迅生物助力中山大学研究团队2025年在PNAS(IF:11.25)上发表《The LIM-domain-only protein LMO2 and its binding partner LDB1 are differentially required for class switch recombination》,此研究将Oligo Pools技术应用在CRISPR基因编辑上:研究团队通过CRISPR基因编辑介导的大规模基因筛选发现并确认了LMO2和LDB1是小鼠成熟B细胞系CH12F3和原代B细胞中的CSR因子。LMO2至少通过促进DNA双链断裂(DSBs)的末端连接并抑制末端去除,部分促进CSR。尽管LDB1稳定LMO2蛋白,但它并不直接参与末端连接,而是作为AID转录的正调控因子,且其作用与LMO2无关,这一功能需要LDB1的二聚化结构域。此外,LDB1通过二聚化直接结合AID启动子并促进AID启动子与上游增强子的环化。
泓迅生物为该研究中的CRISPR基因编辑介导的大规模基因筛选实验提供了sgRNA Oligo Pools的合成。合成的Oligo Pools通过PCR扩增后,被克隆到慢病毒载体中,形成CRISPR文库。这一文库是筛选B细胞中CSR关键基因(如LMO2和LDB1)的基础工具。CRISPR文库具有高通量、高特异性、完全敲除能力和可扩展性,可进行大规模筛选,作者通过该技术不仅验证了已知CSR基因,还揭示了LMO2/LDB1在DSB修复和转录调控中的独立功能,为抗体多样化机制提供了新见解。
泓迅生物Syno®高通量合成平台利用喷墨技术在芯片上单次平行合成高达100万条寡核苷酸序列,最长可达300 nt。精湛的工艺可确保芯片合成均一性高,“五高”优势完美匹配客户下游实验和应用,提高后续高通量筛选效率和成功率:
√ 高通量:单次平行合成高达百万条序列
√ 高精度:错误率低至1:500/nt
√ 高覆盖度:目标序列100%覆盖
√ 高均一性:90%以上的寡核苷酸在2.5倍以内的差异
√ 高性价比:价格低至0.002元/nt
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