荧光分子探针具有结构可变,合成简单和易于修饰等特点,被广泛应用于核酸、酶、蛋白质及细胞等生物分析物的检测中,是分子诊断中不可或缺的研究工具。随着PCR检测技术的发展,对荧光探针的灵敏度、荧光强度、背景信号等指标要求也越来越高。当qPCR探针长,信噪比差时,该怎么办呢?
新品推荐—双淬灭探针
随着探针长度的增加,单淬灭探针的淬灭效果减弱,双淬灭探针的出现很好的解决了这个问题。常规探针在 5' 端有一个荧光基团,在 3' 端有一个淬灭基团。泓迅科技双淬灭探针在常规探针内部增加一个淬灭基团,减少荧光“泄露”现象,在实验中可获得更低的荧光背景信号,提高检测的灵敏度。
双淬灭探针
泓迅科技双淬灭探针与淬灭基团选择列表
通常情况下,SYNO Q1 用于在480-580nm范围内的淬灭,可与常用荧光基团配合使用,如FAM、VIC和HEX等;SYNO Q2 用于在550-650nm范围内的淬灭,如ROX、TXR、TAMRA、CY5和ATTO 647等荧光基团最为有效。
为什么选择双淬灭探针?
高质量的荧光探针可显著提高试验效率和检测准确性。荧光探针的评价标准主要包括:选择性、灵敏度、响应速度、荧光增强倍数、稳定性和生物相容性等。常规核酸探针只有一种效应淬灭荧光!淬灭基团对荧光基团的淬灭能力是有距离限制的,当淬灭基团与荧光基团距离较近时,淬灭效果好,当淬灭基团与荧光探针距离较远时,淬灭效果差,背景荧光信号会增强。双淬灭探针可有效解决“距离”问题,让qPCR试验如虎添翼!
双淬灭机制有效降低背景信号,提高灵敏度
减少多通道检测中荧光信号串扰,具有兼容性
探针长度设计可达40nt,具备更好的选择性
性能 |
常规探针 |
双淬灭探针 |
适用长度 |
<30nt |
<45nt |
降低背景信号 |
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灵敏度 |
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多重PCR适用性 |
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常规探针与双淬灭探针对比
双淬灭探针的应用
双淬灭TaqMan探针应用于新型冠状病毒核酸检测的初步研究
伍嘉豪, 张嫦丽, 王娴默, 范文, 易华伟
在核酸检测中,由于采样和qPCR灵敏度问题,假阴性结果经常发生。为了提升对SARS-CoV-2核酸的检测效果,研究人员开发了一种双淬灭TaqMan探针,其含有两个淬灭基团。与单淬灭TaqMan探针相比,双淬灭TaqMan探针的背景荧光信号更低(161±9 vs 290±18)。此外,研究表明,双淬灭TaqMan探针检测系统具有更好的检测精度(CV 1.4% vs 2.3%; 0.6% vs 2.1%)和更低的检测下限。
单淬灭和双淬灭 TaqMan 探针示意图及探针的荧光信号检测
双淬灭荧光探针在肠癌患者肠道菌群qPCR检测中的应用
臧彩霞,奚晓华,朱会芳等
研究者探讨了双淬灭荧光探针在肠癌患者肠道菌群荧光定量(qPCR)检测中的应用效果。通过接受手术的42例肠癌患者研究组与健康体检成人38例对照组,收集标本,用常规 qPCR和双淬荧光探针qPCR检测肠道菌群的表达量。结果研究组的胆汁酸、血清总胆汁酸、次级胆汁酸均高于对照组(P<0.05)。研究表明,双淬灭荧光探针检测肠道菌群、 胆汁酸的方法便捷,结果准确,对鉴别及筛查早期肠癌患者有指导意义,值得临床推广。
参考文献
[1] Marras SA, Kramer FR, Tyagi S. Efficiencies of fluorescence resonance energy transfer and contact-mediated quenching in oligonucleotide probes. Nucleic Acids Res. 2002 Nov 1;30(21):e122.
[2] 伍嘉豪, 张嫦丽, 王娴默, 范文, 易华伟. 双淬灭TaqMan探针应用于新型冠状病毒核酸检测的初步研究[J]. 病毒学报, 2022, 38 (04): 784-790.
[3] 臧彩霞,奚晓华,朱会芳等.双淬灭荧光探针在肠癌患者肠道菌群qPCR检测中的应用[J].临床医学工程,2023,30(09):1199-1200.
[4] 张园,张海霞.核酸探针及其在生物分析中的应用[J].分析试验室,2020,39(09):1002-1012.