文献分享 | 非互补DNA神经网络:试管中“永生”的分子大脑
近年来,人工智能的快速发展离不开神经网络算法的支撑。然而,电子计算在能效和并行处理方面存在瓶颈,尤其是内存与计算单元分离导致的能耗问题日益突出。在这一背景下,DNA计算因其高能效、高并行性和分子级信息处理能力,成为下一代计算模式的有力竞争者。
DNA神经网络:用分子搭建的“微型大脑”
想象一下,我们能用生命的遗传分子——DNA,在试管里搭建一个微型的“大脑”,让它能像人脑一样识别图案、做出决策。这就是DNA神经网络,一个融合了生物学与计算机科学的前沿领域。
1. 灵感来源:生物大脑
传统人工智能(AI)的运行依赖于硅基芯片和电流信号。而DNA神经网络的灵感,直接来源于我们的大脑。
大脑如何工作:大脑由无数神经元相互连接而成。每个神经元从其他神经元接收化学信号(输入),进行加权汇总。如果总信号超过某个阈值,这个神经元就会“激活”,向其他神经元发出信号(输出)。
2. DNA神经网络:用分子模拟这个过程
DNA神经网络的核心思想是:用DNA分子和它们的化学反应,来模拟大脑中神经元的计算过程。
硬件替换:将电子硬件和软件代码,替换为DNA单链/双链和链置换反应。
信号编码:信息不再由0和1的电流表示,而是由特定DNA序列的有无或浓度来表示。
计算过程:DNA链之间的特异性杂交和置换反应,就像神经元之间的信号传递。
为什么需要非互补DNA设计?
传统的DNA计算严重依赖于完美的碱基互补配对(A-T, C-G)。这种配对非常牢固,但往往意味着反应是不可逆的——就像搭积木时用了超强胶水,一旦搭好就很难拆开重用。
近日,西湖大学研究团队,在国际化学顶级期刊《Journal of the American Chemical Society》 上发表了题为 《Reusable Noncomplementary DNA-Based Neural Network》 的重要研究成果,首次成功构建了可重复使用的DNA神经网络,为分子人工智能的发展迈出了关键一步。
西湖大学团队开创性地提出了“非互补DNA感知器” 的设计理念:
- 可逆计算:通过在DNA双链中引入特定错配,使链置换反应变得可逆,神经网络在完成计算后可恢复初始状态。
- “赢家通吃”决策:引入“歼灭链”放大微弱信号差异,实现清晰的分子级决策。
- 可移除输入:创新性地使用脂质-寡核苷酸缀合物作为输入链,利用其极性差异,在计算后通过简易色谱技术将输入链从网络中物理移除,从而实现了整个神经网络系统的重复使用。
他们采用的 “非互补”设计,故意在DNA双链中引入一些“错配”(就像积木的卡扣不那么严丝合缝),使得整个反应变得可逆。计算完成后,通过简单操作就能让系统“恢复原样”,从而实现重复使用,这是实现分子“学习”功能的关键一步。
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DNA神经网络,本质上是利用DNA分子作为“硬件”,通过模拟大脑的计算原理,在微观尺度上构建的一种信息处理系统。旨在用生命的语言,实现机器的智能。
DNA神经网络对链序列的精确性和纯度有极高要求,任何偏差都可能导致计算错误。泓迅生物凭借先进的合成与纯化平台,确保了每一条DNA链的准确性与可靠性,为实验的可重复性和成功提供了坚实保障。
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Sun C, Liu X, Zhong J, Zhou Q, Cheng J. Reusable Noncomplementary DNA-Based Neural Network. J Am Chem Soc. 2025 Sep 24;147(38):34339-34349. doi: 10.1021/jacs.5c04886.
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